Модуль контроля и управления доступом (СКУД), включающий считыватели, контроллеры, шлагбаумы, турникеты и др., обеспечивает санкционированный проход/проезд в помещения и охраняемые зоны склада. Система выполняет специализированные задачи большого количества пользователей, необходимые для оптимальной работы складского комплекса. Например, к ним относятся подача заявок и обеспечение оперативного доступа на складской комплекс.

Установка электронных проходных позволяет контролировать перемещение персонала, осуществлять учет рабочего времени сотрудников и их нахождения на складе. Последнее особенно важно в случае возникновения чрезвычайных ситуаций - необходимо понимать, покинули ли сотрудники склад или еще находятся внутри его. А вот задачу разграничения доступа персонала и посторонних лиц к тем или иным зонам на складах СКУД, как правило, не выполняет: обычно эта работа ложится на плечи охранников, которые контролируют перемещение лиц из одной зоны склада в другую. Системой контроля доступа на складе оснащаются помещения бухгалтерии, руководства, проходы в служебные помещения, входы на склад и т. д. Также на складе могут использоваться специальные средства защиты - например, металлодетекторы: ручные или стационарные. Это актуально для тех складов, где хранятся технические устройства (компьютеры и др.). Металлодетекторы позволяют минимизировать потери со стороны персонала при попытке вынести товар со склада. Если на складе осуществляется этикетировка (нанесение на товар защитных меток), то могут использоваться и такие специальные средства, как противокражные системы.